O link do boleto tem o formato https://sualoja.com.br/boleto/{chave do pedido}.pdf. O arquivo não existe no disco: o plugin gera o PDF quando o link é aberto.
Algumas hospedagens tratam qualquer endereço terminado em .pdf como arquivo e devolvem erro 404 antes de chegar no WordPress.
Tirar o .pdf
add_filter( 'wc_banco_inter_bank_slip_preview_suffix', '__return_empty_string' );
O link passa a ser https://sualoja.com.br/boleto/{chave do pedido}. O PDF continua o mesmo.
Vale pros boletos gerados depois da mudança: o link fica gravado no pedido (inter_boleto_url).
Trocar o link inteiro
add_filter( 'wc_banco_inter_bank_slip_url', function ( $url, $order_key ) {
return 'https://boletos.sualoja.com.br/' . $order_key;
}, 10, 2 );
Nesse caso, o novo endereço é que precisa entregar o PDF.