O estoque volta sozinho quando o pedido muda pra Cancelado, Reembolsado ou Malsucedido, se ele tinha sido reduzido. Nunca volta duas vezes.
Reembolso parcial
No reembolso feito pela tela do pedido, o estoque só volta se a caixa de devolver os itens ao estoque estiver marcada.
Devolver à mão
No pedido, o quadro Restaurar estoque tem o link Restaurar estoque agora. Ele devolve ao estoque os itens que foram reduzidos e anota no pedido.

O link abre numa aba nova. Confira o resultado nas notas do pedido.
Pra não devolver em algum desses status, um desenvolvedor pode usar os filtros wc_stock_manager_restore_on_cancelled, wc_stock_manager_restore_on_refunded e wc_stock_manager_restore_on_failed (Hooks).